À partir des enjeux de santé prioritaires, le COS détermine ainsi à 10 ans les objectifs généraux et les résultats attendus. Conformément à l’inscription de la santé dans le pacte républicain, il vise la réduction des inégalités sociales et territoriales.
Il fixe les huit orientations stratégiques prioritaires pour améliorer la santé de la population et le fonctionnement du système de santé :
- La santé des femmes, des couples et des enfants
- La préservation de la santé des jeunes
- La santé nutritionnelle
- La qualité de vie et la santé des personnes âgées et des personnes handicapées
- La promotion et la protection de la santé mentale
- La prévention et la prise en charge des maladies chroniques
- L’environnement au service de la santé
- Le renforcement de la veille sanitaire et de la réponse aux situations exceptionnelles en territoire insulaire